转自：药明康德

本年，诺贝尔化学奖的桂冠被授予给三位在卵白质结构预测和遐想领域取得始创性建设的科学家，这标记着科学界朝着运用东谈主工智能（AI）进行卵白质遐想和药物创新的首要滚动。在昔日的十多年里，繁密生物本领初创企业纷纷涌现，它们齐尽力于于运用这一本领来收场卵白质遐想的宏伟谋略。最近，知名行业媒体STAT评比出了在东谈主工智能卵白质遐想领域值得神色的7家公司。在今天的著作中，药明康德的推行团队将联接公开贵寓对这些公司张开先容。

XairaTherapeutics

Xaira Therapeutics是一家玄虚性生物本领公司，尽力于于运用东谈主工智能鼓动人命科学的越过，从新界说药物发现和开拓的方式，并更正疾病调整的方式。该公司众星云集，东谈主工智能运行的卵白质折叠和遐想前驱David Baker证实是其共同创举东谈主之一，前基因泰克（Genentech）首席科学官和斯坦福大学前校长Marc Tessier-Lavigne博士担任首席实践官。

自建设以来，Xaira Therapeutics便得到超越10亿好意思元的资金复古，并勾引了繁密大牌投资者。Xaira公司主要涵盖三大中枢领域：先进的机器学习（ML）筹商、大范畴数据生成以及雄伟的疗法开拓才智。Xaira公司霸术开拓我方的居品线，并与医药公司融合，其重心在于为特定适合症制造合乎的分子，并提供给需要的患者。公司预测其初期名目将基于卵白质，并可能涉足其他分子类型。为此，公司正尽力于于发展东谈主工智能模子，以潜入瓦解疾病生物学。

NablaBio

Nabla Bio于2021年建设，建设之初便得到了1100万好意思元的种子资金，并在本年5月完成2600万好意思元的A轮融资。本年早些时候，该公司布告与阿斯利康（AstraZeneca）、百时好意思施贵宝（Bristol Myers Squibb）和武田（Takeda）等大型医药公司达成政策融合，预支款、里程碑付款和特准权使用费合计可达5.5亿好意思元。

Nabla Bio正在开拓一个集成的东谈主工智能和湿实验室平台，旨在收场精准的药物遐想和药物特点的高通量检测。公司专注于开拓难以成药的靶点，尤其是屡次跨膜卵白，这类卵白质占细胞名义卵白质的三分之二，但在药物开拓中仅占10%。开拓针对屡次跨膜卵白的药物面对一系列挑战，主若是因为这些卵白在细胞膜外涌现的名义积有限，且需要精准划分活性和非活性的受体风景。传统的大范畴文库筛选法度相似无法平静这些精准的条款。Nabla Bio公司选择了一种创新的法度，平直生成具有所需表位、构象和靶标特异性的候选药物。这种法度已被证实行之有用，Nabla Bio的生成式卵白质遐想平台正在解锁数百个以前难以成药的靶点。

此外，Nabla Bio还在开拓微米级容器本领（containerization technologies），这项本领使得公司大概在3-4周内对数千至数百万候选药物的多种东谈主体关联特点进行多重评估。这些丰富的数据将为下一轮的建模和遐想有谋略提供要道信息。Nabla Bio预测在2025年将增多更多的融合名目，并霸术开展数十个新抗体遐想名目。

Absci

Absci是一家东谈主工智能运行的药物发现和开拓公司，专注于抗体领域。该公司已于2021年到手上市。客岁年底，该公司与阿斯利康达成了一项2.47亿好意思元的融合。左证契约，Absci将在融合中运用其创重生成式东谈主工智能本领，为特定的肿瘤靶标开拓调整性候选抗体。契约包括预支款、研发经费和里程碑款项等，总金额高达2.47亿好意思元。

Absci的玄虚药物创造平台联接了生成式AI和一套可延迟的实验室本领。该平台通过测量数百万个卵白质-卵白质互相作用来生成私罕有据。这些数据用于锻练Absci的私有AI模子，并在以后的迭代中考据使用新东谈主工智能模子遐想的抗体。该平台通过在约六周内完成数据辘集、AI运行遐想和实验室考据来加快药物发现。它旨在通过同期优化多种药物属性，并扩大药物靶点范围以涵盖那些以前被以为“不成成药”的药物靶点（举例G卵白偶联受体和离子通谈），从而提高候选药物到手开拓的可能性。

该公司的现存候选药物管线主要鸠合在细胞因子生物学领域，其中，公司针对炎症性肠病的主要候选药物将于来岁头参加临床筹商阶段。

Profluent

Profluent是一家建设于2022年的东谈主工智能运行的卵白质遐想公司，专注于运用深度生成式模子来开拓新式功能性卵白质。公司在建设之初就到手筹集了900万好意思元的种子轮融资，并在本年3月完成了新一轮融资，使得其融资总数达到了4400万好意思元。

与其他专注于卵白质遐想的公司不同，Profluent的主要谋略是基因裁剪而非抗体调整，尽管公司对包括抗体和酶在内的多样卵白质齐推崇出了浓厚的敬爱敬爱。本年4月，Profluent发布了OpenCRISPR，这是一种开源、可编程的东谈主工智能遐想的基因裁剪器具。该公司的研发团队通过对26个基因测序数据库的系统性挖掘，整理出了一个包含100多万个CRISPR独揽子（operon）的数据集。基于其AI模子，筹商东谈主员生成了当然界中CRISPR-Cas家眷的4.8倍数目的卵白质集群，以及为类Cas9效应卵白定制单向导RNA（sgRNA）序列。筹商死心标明，AI遐想产生的裁剪器卵白不错行为开首于酿脓链球菌的Cas9的一个可行替代品，用于基因裁剪本领，具有肖似的裁剪行径，并与碱基裁剪等系统兼容。当今，Profluent公司已公开拓布了OpenCRISPR的首个版块——OpenCRISPR-1。

此外，该公司在8月还发布了基于卵白质结构的话语模子proseLM，进一步延迟了其在卵白质遐想领域的本领才智。

BigHatBiosciences

BigHat Biosciences建设于2019年，是一家专注于开拓下一代抗体的生物本领公司，其筹商掩盖了多特异性抗体、纳米抗体和抗体偶联药物。该公司于2022年完成了7500好意思元的B轮融资，使其融资总数达到1亿好意思元。该公司已与多家大型医药公司，包括默沙东（MSD）、艾伯维（AbbVie）以及强生旗下的杨森公司（现改名为Johnson & Johnson Innovative Medicine）签署了融合契约，正在开拓针对多个靶点的抗体药物。

BigHat Biosciences领有一个名为Milliner的AI抗体遐想平台。该平台可将实验室筹商与机器学习联接起来，使每种抗体从贪图机遐想到抒发、纯化和表征仅需数天时间。运用BigHat的平台，不错遐想功能更复杂、具有更好生物物理特点的抗体，并有助于镌汰优化抗体和其他调整性卵白质的难度。

该公司的AI/ML模子大概学习突变影响抗体分子特点的方式，并在BigHat的平台上收场主动学习的闭环——每个责任单位完成一次从遐想到表征的轮回齐能为下一个轮回积贮和提供信息，使团队能在短时间内快速测试和改造遐想的分子。

除了融合关系外，BigHat公司还领有我方的里面管线，主要鸠合在肿瘤学、炎症性疾病和免疫学领域。该公司当今正在为镰状细胞病调整寻找融合伙伴，并霸术在2026年将胃肠谈癌症抗体偶联药物推向临床。

FableTherapeutics

Fable Therapeutics建设于2022年，建设之初便获利了1000万好意思元种子资金，本年早些时候，该公司到手完成了4350万好意思元的A轮融资。

Fable公司的本领基础来自于多伦多大学前证实、现任Fable首席本领官Philip Kim博士的筹商后果。Kim博士是AI卵白质遐想领域的早期前驱之一，Fable公司正在运用他开拓的扩散模子来开拓卵白质疗法。

在本领层面，Fable公司选择了联接基于序列和基于结构的遐想理念，这在东谈主工智能卵白质遐想领域并不常见。当今，Fable正在其里面管线中开拓一种抗体和一种多肽候选药物，况兼一经与几家但愿运用其先进机器学习本领的医药公司订立了四项未公开的融合契约。

Fable公司交融了面前生物本领领域的两个热点话题：东谈主工智能和臃肿症调整。行为一家专注于东谈主工智能卵白质遐想的初创公司，Fable尽力于于代谢性疾病的调整名目，旨在开拓出超越现存GLP-1疗法的“第三代”臃肿症调整药物。这些新药物的谋略是不仅大概保护和增强肌肉与骨骼，还要提高患者的耐受性，并提供更抓久的疗效。通过这种创新的法度，Fable公司正在开辟一条新的谈路，以期在代谢性疾病调整领域取得残害性进展。

Generate：Biomedicines

Generate：Biomedicines建设于2018年，由Flagship Pioneer孵化，专注于开拓机器学习运行的生成式生物学平台，大概左证需要在等闲的生物模式中开拓新药。客岁9月，该公司完成了高达2.73亿好意思元的C轮融资。

公司的私有生成式平台Generate Platform以连合轮回的方式生成、构建、测量和学习，不错大幅度提高靶标和调整药物的识别和考据速率。其AI药物发现平台Generative Biology大概识别疾病中触及的特定生物经过，联接公司的湿实验室筹商，生成“量身定制”的卵白疗法，包括短肽、复合抗体、酶和基因疗法，平静多样调整需求。

Generate：Biomedicines当今有近十个已浮现的里面和融合候选名目。2022年1月，公司与安进（Amgen）达成了一项筹商融合契约，共同发现和开拓针对五个临床靶点的卵白质疗法，这些疗法跨越多个调整领域和多种调整模式。左证契约，安进公司将为开拔点的五个名目支付5000万好意思元的预支款，潜在交游数额高达19亿好意思元。本年9月该公司布告与诺华（Novartis）开展融合，运用其私有的生成式东谈主工智能平台，通过基于东谈主工智能的优化和从重生成，发现和开拓跨多种疾病领域的卵白质疗法。左证融合契约，诺华将向Generate：Biomedicines支付合计6500万好意思元的预支款。

除了与安进和诺华的融合以外，该公司还有更多未浮现的名目正在进行中，这些融合进一步证实了其平台在药物发现和开拓中的后劲和应用范围。

跟着本领的抓续越过，基于东谈主工智能的本领平台正成为鼓动卵白质科学发展的遑急力量，并为将来的药物发现和疾病调整带来立异性的变革。咱们期待这些前锋公司为莳植东谈主类健康和福祉作念出更多的孝敬。

（转自：药明康德）